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2003年起各地區、各年齡層、性別之病例數統計表(疾病名稱：日本腦炎，日期種類：發病日，病例種類：確定病例，感染來源：本土、境外移入)
| 確定病名 | 發病年份 | 發病月份 | 縣市 | 性別 | 是否為境外移入 | 年齡層 | 確定病例數 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 59180908 | 日本腦炎 | 2003 | 6 | 嘉義市 | F | 否 | 30-34 | 1 |
| 59180909 | 日本腦炎 | 2003 | 7 | 台北市 | M | 否 | 45-49 | 1 |
| 59180910 | 日本腦炎 | 2003 | 7 | 南投縣 | M | 否 | 20-24 | 1 |
| 59180911 | 日本腦炎 | 2003 | 7 | 彰化縣 | M | 否 | 45-49 | 1 |
| 59180912 | 日本腦炎 | 2003 | 8 | 高雄市 | M | 否 | 70+ | 1 |
| 59180913 | 日本腦炎 | 2003 | 8 | 新北市 | F | 否 | 35-39 | 1 |
| 59180914 | 日本腦炎 | 2004 | 10 | 花蓮縣 | F | 否 | 25-29 | 1 |
| 59180915 | 日本腦炎 | 2004 | 5 | 台南市 | F | 否 | 35-39 | 1 |
| 59180916 | 日本腦炎 | 2004 | 6 | 台中市 | M | 否 | 40-44 | 2 |
| 59180917 | 日本腦炎 | 2004 | 6 | 台東縣 | F | 否 | 50-54 | 1 |
| 59180918 | 日本腦炎 | 2004 | 6 | 台南市 | M | 否 | 15-19 | 1 |
| 59180919 | 日本腦炎 | 2004 | 6 | 屏東縣 | F | 否 | 45-49 | 1 |
| 59180920 | 日本腦炎 | 2004 | 7 | 花蓮縣 | F | 否 | 40-44 | 1 |
| 59180921 | 日本腦炎 | 2004 | 7 | 屏東縣 | M | 否 | 30-34 | 1 |
| 59180922 | 日本腦炎 | 2005 | 6 | 南投縣 | M | 否 | 30-34 | 1 |
| 59180923 | 日本腦炎 | 2005 | 6 | 高雄市 | F | 否 | 40-44 | 1 |
| 59180924 | 日本腦炎 | 2005 | 6 | 高雄市 | F | 否 | 45-49 | 1 |
| 59180925 | 日本腦炎 | 2005 | 6 | 嘉義市 | M | 否 | 35-39 | 1 |
| 59180926 | 日本腦炎 | 2005 | 7 | 台東縣 | F | 否 | 50-54 | 1 |
| 59180927 | 日本腦炎 | 2005 | 7 | 台東縣 | M | 否 | 40-44 | 1 |
| 59180928 | 日本腦炎 | 2005 | 7 | 台南市 | F | 是 | 35-39 | 1 |
| 59180929 | 日本腦炎 | 2006 | 10 | 花蓮縣 | F | 否 | 55-59 | 1 |
| 59180930 | 日本腦炎 | 2006 | 5 | 台南市 | M | 否 | 35-39 | 1 |
| 59180931 | 日本腦炎 | 2006 | 6 | 台南市 | M | 否 | 50-54 | 1 |
| 59180932 | 日本腦炎 | 2006 | 6 | 宜蘭縣 | M | 否 | 45-49 | 1 |
| 59180933 | 日本腦炎 | 2006 | 6 | 桃園縣 | M | 否 | 40-44 | 1 |
| 59180934 | 日本腦炎 | 2006 | 6 | 彰化縣 | M | 否 | 55-59 | 1 |
| 59180935 | 日本腦炎 | 2006 | 7 | 彰化縣 | M | 否 | 30-34 | 1 |
| 59180936 | 日本腦炎 | 2006 | 9 | 台北市 | M | 否 | 50-54 | 1 |
| 59180937 | 日本腦炎 | 2006 | 9 | 宜蘭縣 | F | 否 | 40-44 | 1 |
| 59180938 | 日本腦炎 | 2007 | 10 | 台中市 | F | 否 | 0 | 1 |
| 59180939 | 日本腦炎 | 2007 | 10 | 台南市 | F | 否 | 65-69 | 1 |
| 59180940 | 日本腦炎 | 2007 | 5 | 嘉義市 | M | 否 | 40-44 | 1 |
| 59180941 | 日本腦炎 | 2007 | 6 | 台南市 | M | 否 | 55-59 | 1 |
| 59180942 | 日本腦炎 | 2007 | 6 | 南投縣 | M | 否 | 35-39 | 1 |
| 59180943 | 日本腦炎 | 2007 | 7 | 台中市 | F | 否 | 50-54 | 1 |
| 59180944 | 日本腦炎 | 2007 | 7 | 台東縣 | F | 否 | 40-44 | 1 |
| 59180945 | 日本腦炎 | 2007 | 7 | 台東縣 | M | 否 | 30-34 | 1 |
| 59180946 | 日本腦炎 | 2007 | 7 | 宜蘭縣 | F | 否 | 20-24 | 1 |
| 59180947 | 日本腦炎 | 2007 | 7 | 花蓮縣 | F | 否 | 30-34 | 1 |
| 59180948 | 日本腦炎 | 2007 | 7 | 花蓮縣 | F | 否 | 55-59 | 1 |
| 59180949 | 日本腦炎 | 2007 | 8 | 台北市 | M | 否 | 45-49 | 1 |
| 59180950 | 日本腦炎 | 2008 | 6 | 台南市 | F | 否 | 40-44 | 1 |
| 59180951 | 日本腦炎 | 2008 | 7 | 彰化縣 | F | 否 | 35-39 | 1 |
| 59180952 | 日本腦炎 | 2009 | 10 | 屏東縣 | F | 否 | 45-49 | 1 |
| 59180953 | 日本腦炎 | 2009 | 3 | 屏東縣 | M | 否 | 50-54 | 1 |
| 59180954 | 日本腦炎 | 2009 | 5 | 高雄市 | M | 否 | 50-54 | 1 |
| 59180955 | 日本腦炎 | 2009 | 7 | 花蓮縣 | F | 否 | 25-29 | 1 |
| 59180956 | 日本腦炎 | 2009 | 7 | 花蓮縣 | M | 否 | 60-64 | 1 |
| 59180957 | 日本腦炎 | 2009 | 7 | 苗栗縣 | F | 否 | 45-49 | 1 |