本站大部份資料在 2016 年後就未更新，若資料內無明確標示資料時間，請預設該資料為過時資料並斟酌使用，謝謝
2003年起各地區、各年齡層、性別之病例數統計表(疾病名稱：日本腦炎，日期種類：發病日，病例種類：確定病例，感染來源：本土、境外移入)
| 確定病名 | 發病年份 | 發病月份 | 縣市 | 性別 | 是否為境外移入 | 年齡層 | 確定病例數 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 59181058 | 日本腦炎 | 2013 | 6 | 雲林縣 | M | 否 | 35-39 | 1 |
| 59181059 | 日本腦炎 | 2014 | 10 | 宜蘭縣 | M | 否 | 60-64 | 1 |
| 59181060 | 日本腦炎 | 2014 | 10 | 屏東縣 | M | 否 | 30-34 | 1 |
| 59181061 | 日本腦炎 | 2014 | 6 | 台中市 | M | 否 | 50-54 | 1 |
| 59181062 | 日本腦炎 | 2014 | 6 | 彰化縣 | M | 否 | 55-59 | 1 |
| 59181063 | 日本腦炎 | 2014 | 7 | 新竹縣 | F | 否 | 40-44 | 1 |
| 59181064 | 日本腦炎 | 2015 | 6 | 台南市 | F | 否 | 30-34 | 1 |
| 59181065 | 日本腦炎 | 2015 | 6 | 屏東縣 | F | 否 | 50-54 | 1 |
| 59181066 | 日本腦炎 | 2015 | 6 | 苗栗縣 | M | 否 | 70+ | 1 |
| 59181067 | 日本腦炎 | 2015 | 6 | 高雄市 | F | 否 | 45-49 | 1 |
| 59181068 | 日本腦炎 | 2015 | 6 | 新北市 | F | 否 | 45-49 | 1 |
| 59181069 | 日本腦炎 | 2003 | 10 | 嘉義縣 | F | 否 | 35-39 | 1 |
| 59181070 | 日本腦炎 | 2003 | 6 | 苗栗縣 | F | 否 | 20-24 | 1 |
| 59181071 | 日本腦炎 | 2003 | 7 | 台中市 | M | 否 | 30-34 | 2 |
| 59181072 | 日本腦炎 | 2003 | 7 | 桃園縣 | M | 否 | 35-39 | 1 |
| 59181073 | 日本腦炎 | 2003 | 7 | 彰化縣 | M | 否 | 15-19 | 1 |
| 59181074 | 日本腦炎 | 2004 | 10 | 高雄市 | M | 否 | 20-24 | 1 |
| 59181075 | 日本腦炎 | 2004 | 5 | 台中市 | M | 否 | 20-24 | 1 |
| 59181076 | 日本腦炎 | 2004 | 6 | 台南市 | M | 否 | 35-39 | 1 |
| 59181077 | 日本腦炎 | 2004 | 6 | 台南市 | M | 否 | 50-54 | 1 |
| 59181078 | 日本腦炎 | 2004 | 6 | 花蓮縣 | F | 否 | 50-54 | 1 |
| 59181079 | 日本腦炎 | 2004 | 6 | 雲林縣 | F | 否 | 25-29 | 1 |
| 59181080 | 日本腦炎 | 2004 | 7 | 台中市 | F | 否 | 40-44 | 1 |
| 59181081 | 日本腦炎 | 2004 | 7 | 花蓮縣 | M | 否 | 60-64 | 1 |
| 59181082 | 日本腦炎 | 2004 | 7 | 彰化縣 | M | 是 | 30-34 | 1 |
| 59181083 | 日本腦炎 | 2005 | 6 | 台中市 | F | 否 | 40-44 | 1 |
| 59181084 | 日本腦炎 | 2005 | 6 | 台南市 | M | 否 | 55-59 | 1 |
| 59181085 | 日本腦炎 | 2005 | 6 | 南投縣 | F | 否 | 65-69 | 1 |
| 59181086 | 日本腦炎 | 2005 | 6 | 屏東縣 | F | 否 | 30-34 | 1 |
| 59181087 | 日本腦炎 | 2005 | 6 | 桃園縣 | M | 否 | 35-39 | 1 |
| 59181088 | 日本腦炎 | 2005 | 6 | 高雄市 | M | 否 | 10-14 | 1 |
| 59181089 | 日本腦炎 | 2005 | 6 | 新北市 | M | 否 | 45-49 | 1 |
| 59181090 | 日本腦炎 | 2005 | 6 | 彰化縣 | F | 否 | 40-44 | 1 |
| 59181091 | 日本腦炎 | 2005 | 6 | 彰化縣 | M | 否 | 30-34 | 1 |
| 59181092 | 日本腦炎 | 2005 | 7 | 台中市 | M | 否 | 30-34 | 2 |
| 59181093 | 日本腦炎 | 2005 | 7 | 花蓮縣 | M | 否 | 45-49 | 2 |
| 59181094 | 日本腦炎 | 2006 | 5 | 台南市 | M | 否 | 30-34 | 1 |
| 59181095 | 日本腦炎 | 2006 | 5 | 嘉義縣 | F | 否 | 65-69 | 1 |
| 59181096 | 日本腦炎 | 2006 | 6 | 花蓮縣 | F | 否 | 30-34 | 1 |
| 59181097 | 日本腦炎 | 2006 | 6 | 花蓮縣 | M | 否 | 50-54 | 1 |
| 59181098 | 日本腦炎 | 2006 | 7 | 桃園縣 | M | 否 | 70+ | 1 |
| 59181099 | 日本腦炎 | 2006 | 7 | 新北市 | F | 否 | 30-34 | 1 |
| 59181100 | 日本腦炎 | 2007 | 10 | 高雄市 | M | 否 | 50-54 | 1 |
| 59181101 | 日本腦炎 | 2007 | 6 | 桃園縣 | M | 否 | 40-44 | 1 |
| 59181102 | 日本腦炎 | 2007 | 6 | 高雄市 | F | 否 | 50-54 | 1 |
| 59181103 | 日本腦炎 | 2007 | 6 | 高雄市 | M | 否 | 40-44 | 1 |
| 59181104 | 日本腦炎 | 2007 | 7 | 桃園縣 | M | 否 | 50-54 | 1 |
| 59181105 | 日本腦炎 | 2007 | 7 | 雲林縣 | F | 否 | 35-39 | 1 |
| 59181106 | 日本腦炎 | 2007 | 7 | 新北市 | M | 否 | 30-34 | 2 |
| 59181107 | 日本腦炎 | 2008 | 6 | 高雄市 | M | 否 | 40-44 | 1 |